参考基因组比对,sam为空

老师我在建立好索引之后,与参考基因组比对失败了,sam文件都是空的,summeattachments-2020-09-r8dWLlGD5f7335d5951ce.png我的命令是这样的:

attachments-2020-09-Vk4GrVfq5f7335e531d3e.png--rna-strandness RF这个链特异性参数有没有都是一样的结果,请求老师帮助。

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2 个回答

Iron

attachments-2020-09-D61meEz65f7336f23a356.png这是我的索引

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

索引的路径把文件后缀删掉:


attachments-2020-09-oLHaHV685f73e9e8b0a63.png

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