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文章 IF=6.2 | 银杏生理性叶片灼伤的转录组和代谢组联合分析

...hysiological leaf scorch in Ginkgo biloba L.”的转录组-代谢组联合分析文章。” 01 — 研究背景 银杏(Ginkgo biloba L.)作为现存最古老的裸子植物之一,仅是进化生物学研究的“活化石”,更是重要的药用和经济树种,其叶片和种...

问题 想请教一下,我是基于windows+docker做的宏基因组注释,然后在去宿主这一步,卡住了 知道为啥 一直

文章 清华学生是如何度过大学4年的

...在清华很多。 邓小平说:“科学技术是第一生产力”,错,再给大家举一个例子:我们都该玩过的那种红光激光笔,我前几天在市场上看到最低的一款售价是3元人民币。我们系信息光电子所做的一个项目“绿光半导体激光笔...

文章 怎么得到基因组之间的结构变异结果?​

...enome1.fa > genome1_standard.fa 注意事项:确保比较的基因组版本一致,染色体数量和质量可控。 基因组比对 1.1 同种基因组比较(使用MUMmer) # 生成全局比对nucmer --maxmatch -g 1000 -c 90 -l 40 -t 10 -p 前缀 ref.fa genome1_standard.fa 1.2 同属...

文章 吐血推荐!来自科研老司机的国庆7天出游指南!

...祖国母亲生日的时候还在埋头苦学呢? 是因为无聊吗?! 是心中对导师的眷恋、对事业的追求、更是对科研的爱好啊!!! 然而,该出去玩还是得出去, 长假好容易1年只有1次,你也需要好好考虑这漫漫长假如何度过...

问题 gatgatk硬过滤的时候 --filter-expression "QD < 2.0 || MQ < 40.0 || FS > 60.0 || SOR > 3.0 || MQRankSum < -12.5 || ReadPosRankSum < -8.0" --filter-name 'SNP_filter' -O all.filter.snp.vcf.gz --cluster-window-size 5 --cluster-size

出现这样的提示,有问题嘛?

文章 ceRNA网络构建

...网络构建步骤 1. ceRNA调控机制:circRNA与miRNA的互作 通过分析得到73个差异circRNA和27个差异miRNA。已有全部circRNA与miRNA的互作关系。通过筛选,得到64个差异circRNA和23个差异miRNA及其互作关系。 2. ceRNA调控机制:lncRNA与miRNA的互作 ...

问题 到底选哪些样品构建WGCNA

各位老师,就构建WGCNA共表达网络,我有一个疑问:我分析了一个芯片27例癌旁,30例癌(这些癌和癌旁有些事配对的,有些又配对)。我筛选出癌和癌旁的DEGs之后,准备构建加权网络。但是这里用于构建加权网络的差异基因...

文章 BaiduPCS-Go 使用小技巧

...<提取码> 注意: 转存文件保存到当前工作目录下, 支持指定. 例子 BaiduPCS-Go transfer https://pan.baidu.com/s/12L_ZZVNxz5f_2CccoyyVrW?pwd=edv4 5. 下文件更改保存文件夹 config set --savedir 自己想保存的文件夹BaiduPCS-Go d 网盘文件 ...

问题 利用单拷贝直系同源基因蛋白序列做分歧时间树mcmctree

...错,我觉得可能是软件安装的问题,请问我需要安装哪个版本的软件呢? 比如我跑mcmctree mcmctree1.ctl时总报错:running codeml tmp0001.ctl  sh: codeml: 未找到命令

问题 老师,我的结构域搜出来全都是这种显示我的家族GASA这种字母的,是是就说明我的这个结构域存在?

问题 我想问一下,我这个表格读进去,知道是为什么?有没有解决办法。表格内容就是24个样,20个家族成员的fpkm值的表格

文章 选生物专业怎么样?就业前景好吗?

...看, 家长们也要视孩子具体的情况而定,具体情况具体分析。 譬如说,孩子如果是亲生的,就建议选这个专业了。 生物女学霸,一个自称学霸其实很渣的生物汪,努力将有趣的、有用的、有血有肉的科研那些事儿呈现给...

文章 R语言-Cox比例风险模型

...归模型。该模型以生存结局和生存时间为应变量,可同时分析众多因素对生存期的影响,能分析带有截尾生存时间的资料,且要求估计资料的生存分布类型 Cox模型的基本假设为: 在任意一个时间点,两组人群发生时间的风...

文章 叶绿体/线粒体散在重复序列注释——REPuter

...everse (R),互补 Complement (C),回文Palindromic (P)。 REPuter 是在线注释的网站, 详情可参考文献  REPuter: the manifold applications of repeat analysis on a genomic scale 一、操作 REPuter网站 https://bibiserv.cebitec.uni-bielefeld.de/reputer 1.进入网站后...