... molecular interactions (MITOMI) MITOMI是少数可以测量TF与DNA解离系数Kd的实验技术，它具有中等通量，但却不适合用于denovo的TFBS鉴定。MITOMI具体流程图4： 1. 将感兴趣的TF固定在玻璃上，接通微流管，倒入DNA； 2. DNA结合到固定的TF上...
WGCNA分析进行模块和性状相关性分析时，trait文件如何做？ 例如以下面paper中的图为例 实验设计是：选取了两个大豆品种做转录组分析，分别是：大籽粒Wandou 28 (V1)，小籽粒Peixian Layanghuang (V2)，取样时期为三个时期：seed set (S1), ...
...体内两种不同的调控功能的生物学功能的观点。进而通过比较基因组学的方法，深入研究了HKT基因家族的分组分类和保守特性，发掘了该基因家族的功能特征。本研究为HKT在植物生长发育中相关胁迫应答和培育改良抗性品种奠定...
...到两个相关性较高的模块，模块1（基因数量20932 相关系数0.91，p值0.002），模块2（基因数量539 相关系数-0.89，p值0.003）.。 1、相关性高的模块基因数量占了三分之二，这个合理么？是不是低丰度的基因多，所以...
...enn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 组别标签位置进行调整 可以基于VennGetSetLabels 和VennSetSetLabels 进行，前者获取当前绘图对象的Set标签的位置，进行修改后，利用后者整合到绘图对象中，重新绘图 获取组别标签的位置信息...
...都是轻链？ 答：因为抗体重链在抗结合活性和结构方面比较重要，所以链置换策略常采用轻链替换，以尽量避免链替换后抗体结合特异性发生变化。 2、抗体库技术与单、多抗技术相比，有何优劣？ 答：优势：抗体库技术...
SMART（http://smart.embl.de/）是我们常用来进行domain搜索和蛋白质注释的数据库，它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具，比如可以预测蛋白的一些二级结构：跨膜区（Transmembrane segments）、复合螺旋区（coiled coil regions）、信...
...过R包“randomForest”建立肠道菌群与婴儿年龄的随机森林回归模型(random forest regression model)，最终找到了20个与婴儿年龄相关的重要OTU。上图a，通过交叉验证筛选了20个显著的OTU。上图b，热图展示这20个物种平均相对丰度随着婴儿...
...以选择进行log进行数据标准化。 而且后续进行单因素cox回归分析时，运行到 # 将单因素的结果汇总，形成一个dataframeUnivar <- ldply(Univar, data.frame) 得不到结果。 请各位老师和同学指点迷津，十分感谢！
...好的genome.fa文件，但是里面有些染色体需要手动调整，我如何区生成.hic和.assembly文件，我看教程里似乎要组装后genome.fa文件进行与hic数据的比对，但是verkko的组装结果文件里似乎没有这个文件？
桑基图，也叫桑基能量分流图或者桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，所有主支宽度的总和应与所有分出去的分支宽度的总和相等，保持能量的平衡，非常适用于用户流量...
请问老师 比如这个图 是不是看Pi的比较顺序 左边的受选择区域是分子上（ZQ）的群体的，右边的受选择区域是分母上（ZD）的 群体的？不知道是否可以这么说。我看好多文章都有这个规律。我的是公司给的图，技术人员说这个...
...己公司和服务器上，泄露和被黑客攻击的可能性较低，是比较安全的一种部署方式。 ②自主性较高：因为所有的数据都被买断，购买本地安装的企业，如果不考虑成本，完全可以根据自己的需求进行私人定制，自主性较高。 ...
...试着用自己的数据去跑这个流程，前面都很顺利，就是在比较男女之间基因表达差异那里出了错误，因为我的数据是从小米的根，茎，叶三个不同组织里得到的，所以我想比较这三个不同组织的基因表达差异情况，但是R代码我...
...的处理，数据来源等对数据进行整理，将能够进行生物学比较和统计的样品数据归纳整理到一起，形成唯一的DataSet record（GDS accession）。在这个DataSet中，所有的样品数据来源于同一种平台，数据背景处理和标准化方法都一致。 ...