...一步看看这两个基因家族分别有哪些成员，然后进行生信分析。这个物种的基因组是得到过前人测序的，但是不知道应该怎样从已知的基因组文件里去搜索和找到这两个基因的所有成员，是需要看注释还是怎么操作？如果是从注...
...和成本来考虑，取处理前后2个点（即4个组）做全转录组分析是否可行？另外，关于生物学重复，3个单独生物学重复肯定最好，如果事先混合为一个样品是否有效？
...v BnaA01G0307600ZS.recode.vcf -g $datadir/ZS11.v0.gff3 -p $datadir/Sugar2025.txt -G $datadir/group.txt -c scaffoldA01 -s 28774799 -e 28776525 WARNING: ignoring environment value of R_HOME --> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/ --> R beginners ?...
最后绘图输入命令 perl /home/manager/share1/script/circos.pl --chr chr_length.txt --circle link.txt --type link --circle text.txt --type text --od circose1 但显示出现如下问题 注：bio-linux版本已更新 请求老师帮助指点
我之前安装的docker最新版本，使用window shell运行 docker run -it -m 20G --cpus 4 --rm -v D:/ampliseq:/work omicsclass/ampliseq:v2.0 没有问题。 但是，我现在想使用你们推荐的docker（主要为了调整CPU和内存）。 运行 docker run -it -m 20G --cpus 4 --rm -v D...
...就是用 uptime 的时候，会出现的资讯。/proc/version 核心的版本，就是用 uname -a 显示的内容。/proc/bus/* 一些汇流排的装置，还有 U盘 的装置也记录在此。/usr目录/usr 最庞大的目录，因为所有应用程序几乎都安装在这里， 本地安装...
老师，请问除Vennerable外，有没有其他的包可以做出六维Venn图呢？Vennerable做的六维Venn图太难分析了，不直观，如图A；我想做出图B样式的六维Venn图，有什么其他办法呢？
...及发现问题。 主要的成果物也不只是数据报告或者是分析结论，而更是跨系统、跨产品线、跨领域综合而成的数据类产品。 ——这么多工作，那数据产品经理的能力模型应该是怎样的？ 按照《数据产品经理修炼手册》一...
老师，你好，我现在学习基因家族分析这门课程，刚刚学习到预测顺势作用元件这节内容，我按照课程一步一步操作的。现在遇见一个问题，如图片红色波浪线所示。才接触这么课程，很多地方不懂，敬请答疑解惑，谢谢！
....names =T, quote = F) 除了下载数据，TCGAbiolinks 还集成了差异分析，生存分析等功能，有兴趣的朋友可以去尝试一下。 如果你对TCGA数据挖掘有兴趣的话，可以学习我们的TCGA相关课程。 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-生存分析...
...文，文章通过组装染色体水平物种基因组，群体重测序等分析，首次揭开了骆驼蓬属物种的起源、分化历史及适应性进化机制，并提出创新性的“混合-隔离-再混合 ”（MIM）循环模型” 01 — 研究背景 骆驼蓬属是中亚干旱...
一、搭建roll-server 不同于以往版本的rocks，rocks 7.0 更改了roll的安装方式，并且官方还搭建了roll-server。可是鉴于网络原因，我们使用官方的roll-server会有慢卡断等问题，所以还是本地搭建服务器为佳。 1、镜像下载 我们首先要...
进化树的构建 （1）数据准备在进行系统发育分析时需要通过构建系统发育树来描述不同物种或者基因之间的进化关系，通过同源DNA的核苷酸序列或者同源蛋白质分子的氨基酸序列可以实现构建进化树的构建。（3）序列比对为...