5 关于比较转录组的实验设计

我想通过转录组学对耐寒和不耐寒2个作物品种进行研究,在正常状态下,2个品种生长没差异,经过冷处理后表现明显不同。从有效性和成本来考虑,取处理前后2个点(即4个组)做全转录组分析是否可行?另外,关于生物学重复,3个单独生物学重复肯定最好,如果事先混合为一个样品是否有效?

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1 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

1、处理节点的选择 取样的两个点虽然是一前一后,但是具体的时间点最好通过预实验确定, 设置不同的时间点取样,特别是处理后,选择处理后的一个具体时间点 的理由最好能在文章中说明 并附上照片证明(举例:处理0点 1h 2h 3h 4h ....哪一个时间点出现的变化明显并且具备明显的生物学讨论意义,给出各阶段的照片或者生理生化指标说明这个问题)

2、标准实验操作不建议混样 目前转录组文章对混样测序会比较排斥

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  • 提出于 2019-08-05 10:16