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文章 deepseek绘图之--系统发育树

...模型的介入彻底改变了这一局面。只需提供您的群体遗传数据(如Newick/NEXUS格式的树文件),并用自然语言描述定制需求(如标注群体分组),AI即可自动生成"端到端"绘图脚本:从数据解析(处理缺失数据、优化分支布局)、...

文章 blastall 参数详细说明

...-p、-i、-d、-o、-e等几个。 -p: 执行的程序名称-d: 搜索的数据库名称-i : 要查询的序列文件名(Query File)-e:(数学)期望值(Expectation value),E值是个统计阈值,缺省值10, 意指比对结果中由于随机偶然性产生的匹配结果不大于10,E值越小...

问题 老师,我的文本矩阵中已经全部是数值型数据了,没有NA的形式,在运行简单热图代码pheatmap(ORFs)时可以成功;但是在标准化后在运行热图代码pheatmap(ORFs,scale = "row")时就显示了和之前同样的下列错误,这是为什么呢?麻烦老师,多谢啦。

新:Species_ORFs_heatmap.R                Perl_result5_revise              旧: Perl_result5_revise     genus_ORFs_heatmap.R

文章 100+篇2019基因家族分析SCI(1-3月发表)文献免费领取(文末领取)

...件分析; 6. 家族内基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 不了解基因家族分析论文思路的小伙伴可以参考以下几篇最新基因家族分析类文章精讲(点击蓝色字链接):抗逆性基因家族分析;钾离子转运载体基因家族分...

文章 领取180篇2018年最新基因家族分析类文献(文末领取)

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

问题 GWAS分析绘制QQ图时,Observed值与Expected值相差较大

老师您好,想请教您个问题,我有两年数据,两年合在一起的数据和20220年数据分析正常,但是2025年的数据分析异常,用tassel分析了一般线性模型和混合线性模型,用GEMMA做了一般线性模型,结果都如图所示,运算脚本 tassel GLM...

文章 8.28接收-毛竹bHLH基因家族分析文章解读及原文献下载

... 1. 毛竹中bHLH基因家族基因的鉴定 作者利用毛竹基因组数据,根据Pfam数据库中Hidden Markov Model (HMM),一共鉴定到137个bHLH基因候选基因。 2. 构建系统发育树和bHLH家族基因选择压力分析(Ka/Ks计算) 作者选择拟南芥144个, 作者选...

文章 Windows远程桌面设置及使用方法

...简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 开年第一篇!2区基因家族分析文章赏析!苦荞MAPK家族分析-2022年2月3日,最新文献!

...联系llcheng1314,我们将给您提供最优质的、最具性价比的数据分析服务。 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,又能发文章,又能学生信技能,一举两得的SCI好思路;基因家族分析课程已...

问题 生存分析报错

重复一次 我再到r里重复了两次,这次还出现直接报错它说什么外接函数不能有NA,难道是临床数据的两个days下面有NA的原因我用课件里提供的数据也仍然会报错 意思好像就是迭代次数不对还是怎么的,求求老师解答

问题 illumina芯片矫正

...问怎么矫正?不知道老师有没有发现这个问题  我选的数据 课上的例子数据

文章 TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later

 在采用TCGAbiolinks 下载TCGA数据时,有时候会出现“Error in value[[3L]](cond) :    GDC server down, try to use this package later”的错误。 这个错误一般不会出现,除非GDC的网站有问题,检测方法有两种: 1.  在R中运行如下命令: > Genom...

文章 linux下替换文件中的换行符

...却发现没有任何效果,百度之后发现 sed是按行处理文本数据的,每次处理一行数据后,都会在行尾自动添加trailing newline。 如果非要使用sed命令,实现替换file文本内容的换行符为空的话,那么就要了解sed的分支条件命令,以及...

文章 生物汪看《疯狂的外星人》,心真累!

...群体规模的测序项目;每台HiSeq X仪器三天可产生1.8 Tb的数据,即每天600 Gb;若同时运行10台仪器,每年可测序>18,000个人类基因组。 2. NovaSeq测序仪:NovaSeq 5000和6000系统的售价分别为85.0万和98.5万美元,可单台购买,相比HiSeq 25...

文章 当下,转录组文章怎么写?

...3次,每样由独立5株材料混合而成。具体设置如下图: 数据分析结果: 如下图,较为细致地介绍了本文的分析内容。 首先是转录本组装及功能注释分析,该部分内容多数文献描述均类似,此处不再详述。各种基因表达差异...