...。但其中只有GeneMark是必须的，因为我们更多是利用RNA-seq数据进行模型训练，而GenomeThreader, ProHint是利用同源蛋白进行注释才用到，其中GenomeTrheads是处理近源蛋白，而ProHint是处理未知距离的蛋白。#基因组命名应该简单，最好就...
我们在使用clusterProfiler做GO富集分析的时候，需要在Bioconductor上下载目标物种的注释包，比如人类的： 有一些物种的注释包是能够下载到的，Bioconductor上提供了以下19个物种的Org类型的包，包含了这些模式物种的GO及KEGG注释...
...在地域的Endpoint。各地域Endpoint详情，请参见访问域名和数据中心。您也可以增加http://或https://指定ossutil访问OSS使用的协议，默认使用HTTP协议。例如使用HTTPS协议访问深圳的Bucket，设置为https://oss-cn-shenzhen.aliyuncs.com。accessKeyID、ac...
Mn Zn Cu Pb Cd As Hg 1 -0.661 -0.675 -0.227 -0.67 -0.623 0.072 0.027 2 0.004 0.003 0.381 0.003 0.008 0.784 0.919 3 -0.662 -0.685 -0.327 -0.721 -0.612 0.286 -0.081 4 0.004 0.002 0.2 0.001 0.009 0.265 ...
run_pipeline.pl -Xmx200G -fork1 -h hapmap.ordered.hmp.txt -fork2 -importGuess GZ.tsv -combine3 -input1 -input2 -intersect -FixedEffectLMPlugin -endPlugin -export hd 检查了表型，都是数据，表型也更改为下划线了，依然是同样的报错
...简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
...件一样MD5值一定一样，反之MD5值一样并不能保证压缩前的数据是一样的。在密码学上发生这样的概率是很小的，所以MD5在密码加密领域有一席之地。但是专业的黑客甚至普通黑客也可以利用MD5值实际是有损压缩技术这一原理，将...
...ene_exp_download.r -g GSE43488 -G GPL13667-15572.txt 结果输出: 数据整理说明 探针与基因对应： 1.一个基因对应多个探针： 取均值，最大值，等 2.一个探针多个基因，取第一个基因名字 表达量是否需要重新标准化： 可以通过boxpl...
...留一个作为基因的代表，此步建议对脚本输出的文件手动筛选，挑选ID： perl script/select_redundant_mRNA.pl mRNA2geneID.txt WRKY_domain_new_out_selected.txt WRKY_remove_redundant_IDlist.txt 查看解答区的相似问题：老师的解答为：GFF文件可能不是标准...
...因表达量热图 文章使用网上已发表文章的转录组表达量数据，绘制了TLP家族基因的表达量热图。 qRT-PCR定量分析 分析的最后，作者处理了一批甜瓜，并分不同的时间取样，针对鉴定到的28个TLP家族基因进行了定量分析。 到...
您好！就是在检查数据是否正确时 出现以下错误> exprSize = checkSets(multiExpr)，我看过您的回答：checkSets设置一下参数（checkStructure=T），能否详细点，在哪里设置参数呢？> multiExpr[[1]]$data[1:5,1:5]这个问题该怎么样解决？谢谢您...