如果geo下载的矩阵是标准化的但没有去log，那我利用这个矩阵用Excel计算出log值以后再用lima包进行差异分析吗？还是说需要重新下载原始数据用r进行标准化处理呢？ - 组学大讲堂问答社区

5 如果geo下载的矩阵是标准化的但没有去log，那我利用这个矩阵用Excel计算出log值以后再用lima包进行差异分析吗？还是说需要重新下载原始数据用r进行标准化处理呢？

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分类：GEO

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-07-23 17:27

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以自己计算log值再用lima分析的；GEO芯片数据挖掘、 GEO芯片数据不同平台标准化

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小加伟提出于 2020-07-23 16:12