...基因。 有时候需要检索的物种很多，如果分别下载就会比较麻烦。其实在NCBI检索结果页面的检索框下方会有个不起眼的"send to"按钮，这是快速下载检索基因序列的关键。 这个send to 可以理解为保存检索结果，有很多种方法可...
最近在调试代码的时候，发现总是有问题，最后才发现是windows当中用记事本编辑过这个文件，导致换行符与linux当中不同，导致脚本出错。因此建议统一编码格式utf-8；避免由于换行符导致错误： 小知识windows中的换行符：\r\nlin...
近年来，基因组测序爆炸性增长，比较基因组学已逐渐成为每个物种尤其是首次被破译基因组的物种的必备研究内容之一。那么什么是比较基因组学呢？比较基因组学是通过对系统发育中的代表性物种之间的基因和基因...
...，在取样时样品的处理很重要，处理之间（或者表型差异比较大）对差异基因的数量影响很大。 第二：生物学重复之间的相关性（也就是重复性），生物学重复之间的相关性越高，样品间的相似性就越高，组内的差异小于组...
...恩图时较为常用的一个R包，通过对其中的相关参数进行调整可以达到不同的个性化效果，今天我给大家介绍一些常用的绘图参数： ###venn.plot <- venn.diagram(gene_list，#输入的基因数据scaled = FALSE，#不根据数据的大小来自动调节圆...
...;0.0001, 9999 permutations) ” 文章还列出个元素之间的spearson 系数，如下图。我想问一下，在制图过程中，怎么设置这个ρ和p的范围呢，是在conet 的method mean这个菜单中填入相应的值吗，还有permutations和bootstrap这个值是怎么设置的呢...
... 1 M，一些裸子植物超过 4 M）。细胞器基因组序列本身就比较短，重复序列也比较简单，分类方式不像核基因组那么复杂。一、细胞器基因组重复序列分类串联重复序列（tandem repeats），由重复单元首尾相连、成簇排列而成。简...
老师在课程中使用的示例文件中vcf文件中四个样本的顺序是双亲，然后子代。但是我发现我的vcf文件的顺序是双亲在后面，两个子代池在前面，这种怎么调整顺序呢，或者会不会影响qtlseq的运行
老师您好，之前我问过出现找不到基因的原因，您让我简化一下ID，https://www.omicsclass.com/question/5477。我简化后还是出现如下报错： 后来我先画了2个物种，可以出来图，再画了3个物种，也可以出来，，增加到4个物种时就又开...
...8:44) , mantel_fun = 'mantel')#根据相关系数和显著性设置标签，以便作图时定义线宽和颜色mantel <- mutate(mantel, rd = cut(r, breaks = c(-Inf, 0.2, 0.4, Inf), labels = c('< 0.2', '0.2 - 0.4', '>= 0.4')), ...