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文章 使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

...到一个收敛的结果,如果1000次计算还是不能收敛,需要调整隐藏因子的数量 iteration 0/1000 iteration 1/1000 iteration 2/1000 iteration 3/1000 iteration 4/1000 iteration 5/1000 iteration 6/1000 iteration 7/1000...

问题 重复序列注释问题

...at.sh 脚本时如果中间报错,例如未找到某个文件的时候,如何查看是哪一步出错,哪些运行成功了,从而从报错的命令之后运行?

问题 16S 差异比较使用compare_errorbar.r的时候报错

我用这个代码是他的前一步不报错,但是这一步报错,代表我的分组信息这些都是准确的 这个代码不报错 for i in {2..6};do     Rscript $scriptdir/meta_stat.r -i ../05.export_data/taxa_summary/absolute_abundance/feature_table_tax_L$i.txt \ -m $metadata -...

问题 GEO数据标准化问题

自己找了很多序列但是没有一个能像视频课讲解的案例的方式标准化处理,请问老师这些该如何标准化并分析?序列.docx

文章 BSA分析之MutMap分析原理详解!

...就是连锁区域。在附近进行候选基因的筛选和排查,可以比较容易找到突变基因。 如何确定突变碱基 作者利用重测序的方法,对野生型品种(Hitomebore)进行重测序,将read比对到参考基因组日本晴(Nipponbare )上,将Hitomebore...

文章 多基因间共线性及局部基因水平的共线性

之前编在 基因组间共线性分析想学吗 这篇文章分享了如何用MCscan做基因组共线性分析,不过文章只是介绍了共线性分析的一种做法,今天编接着讲讲共线性分析还能怎么做! 三基因组共线性分析 之前的文章讲的是葡萄...

问题 基因家族成员命名

...有其他研究者研究过并对其命名的话,在文章中,我应该如何命名这些基因?

问题 kaks计算过程问题

您好,我们采用了aln2axt.pl脚本运行,但运行得到的axt文件仍然不equal,我们检查了我们序列的长度,序列比对总长度是3的整倍数.序列都含有起始密码子ATG,请问一下如何解决呢?

问题 一个酶基因家族里边具有两个结构域

蔗糖合酶基因家族里边,同时具有两个结构域,这个脚本该如何变啊

问题 GSDS展示图中想修改下基因名称

如何在GSDS中修改下基因名称呢,是修改gff文件吗,这是文件

文章 细胞长不好?那是你没选对细胞因子!

...细胞因子的添加,则是整个细胞培养过程中的重要环节,如何选择正确、优质、可靠的细胞因子对后续实验,如肿瘤、免疫、干细胞等相关研究都至关重要。 特别是如今干细胞治疗、CAR-T细胞治疗等领域非常火热,对细胞因子...

问题 sra文件转换为fastq文件

用迅雷在ncbi上下载的.sra格式文件,下载保存在了本地,如何转换为.fastq格式文件?请各位老师同学指点,谢谢!

问题 Cytoscape图片导出的问题

请问老师,我在软件中美化好的图片跟导出的图片不相同应如何解决,1是软件中美化好的图片,2是导出的PDF图片  想要导出后的图片连线为直线 并且没有无效文字的显示

问题 MEGAX 比对后的gaps删除

老师您好! 现在用MEGAX建树,在比对完成后不能像以前版本的mega,直接手动选中要删除的位置。请问应该如何手动删除gaps?

问题 docker里删除文件夹

老师好,想问下在docker里如何快速删除文件及文件夹?现在删除文件/文件夹总是会提醒是否删除,对了删除文件夹来说,每个文件都要按y,很费劲。