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问题 转录组的差异基因的注释

...有可能选择的基因组没有上传到NCBI吗?如果这样的基因比较多,是否需要考虑更换基因组? 2.在得到的全部差异基因中,按功能注释查找目的基因,可能会出来好几条差异基因,这样的情况下是不是需要把每条的核苷酸序列都...

文章 第7期-武汉站-《转录组结果解读与挖掘精讲班》邀您参加!

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

文章 基因功能注释数据库DAVID 版本的更新情况

DAVID 是一款比较方便使用的基因功能在线注释网站,能进行一些基因ID的转换,还能够进行GO,KEGG的功能注释和富集分析。 十年前,基因功能注释的软件非常的少,DAVID 非常的流行,为广大科研人员所喜爱。但DAVID却在大家的溺...

问题 mega构树

想请教一下老师,mega软件导出来的network文件,用figtree打开为啥是数?figtree中如何只显示大于70%的bootstrap值?

文章 MISA(在线)注释叶绿体基因组SSR

...长短,可将其细分为如下几类。 < 6 bp 微卫星DNA10-60 bp 卫星DNA100-300 bp 卫星DNA 等。。。今天介绍一款可用于鉴定基因组SSR的在线网站,MISA(Misa-web - IPK Gatersleben (ipk-gatersleben.de)) 对叶绿体基因组进行SSR的鉴定,因为叶绿体...

文章 简单的蛋白质组实验怎么炼成4分文章

...章就完成了。 总结 从本文可看出蛋白质组学文章还是比较好发的,起码来说4分左右的文章不需要太多的补充实验和花哨的分析内容,这也比较符合许多初学者的胃口。 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现...

文章 不同物种基因组之间的比对与可视化

基因组比对是将两个或多个基因组的序列进行比较,以寻找它们之间的相似性和差异性。这种比对可以揭示基因组之间的演化关系、结构变化、共同的基因或 序列以及可能的功能元素。基因组比对是生物信息学中非常重要的任...

文章 华为是如何绝地反击,强势崛起的?(2)

...手机品牌的厂商,SoC基本不外卖。 联发科的基带性能也比较差,断流家常便饭,体验不行。 即使苹果已经如传言所说开始联发科研发自主基带,勉强能用也至少需要两年。之后即使再迭代三四次,也很难达到华为高通基带的...

问题 构建进化树

利用hummer搜索之后得到相应的序列,在构建进化树过程中,出现以下问题: (1)(2)如何删除序列差异较大的gap,若有,请给予详细的步骤

问题 共线性分析代码报错

请问老师如何解决

问题 TBtools报错

想在tbtools中制作基因结构图,结果因为发育树中将基因ID改成WRKY1,WRKY2对应不上报错了,请问如何解决呢

文章 教你画多物种基因家族局部共线性分析图

...并将 GFF 转换为 BED 文件并重命名它们,同时根据BED文件调整CDS文件,保证最终BED文件和CDS文件中id一致。 #将gff压缩文件转换成bed格式python -m jcvi.formats.gff bed --type=gene Sc.longest_isoform.gff3 -o Sc.bedpython -m jcvi.formats.gff bed --t...

文章 可变剪切在癌症中的研究

...KM生存分析。为了评估预后模型的性能,采用ROC曲线进行比较分析;基于所有可变剪切事件构建的预测模型最优。 可变剪切显著相关基因的互作分析 由于一个基因可能存在多种类型的可变剪切形式,分别统计含有不同类型可...

问题 circosb报错

老师,您好!我在绘制circose时出现以上的错误,请问如何解决? 我用了软件自带的例子来测试程序是没有问题的,能够得到图,但我自己的报错了。

问题 基因组注释

老师用你们基因组注释的镜像和脚本进行EGGNOG注释一直提示里面没有tidyverse这个R包,请问应该如何解决。