...据比对结果进行聚类,得到 直系同源组(orthogroup)。其中每个 orthogroup 的蛋白及序列信息存放在 Orthogroup_Sequences 文件夹中,单拷贝 orthogroup 的蛋白及序列信息存放在 Single_Copy_Orthologue_Sequences 文件夹中,orthogroup 的统计信息存放...
蓝色背景的是我shell中的程序,黑色的是视频中的程序,在运行到原始测序数据两端合并时,出现以下错误,请指教问题所在
已知GEO数据库中某个数据的GSE号,如何通过数据分析得到某个基因的表达量数据呢?
老师,我正在泛基因家族分析中结构变异基因注释最后一步,#从结构变异注释文件中提取WRKY基因结构变异信息 grep -f ${ref}_gene_without_lable.list All.variant_function > All.final.sv.out 我拿到的vcf是我研究的基因家族的vcf文件,按理说我...
...ence: 基于物种丰富度(种类有无)的计算距离矩阵,样品中稀有OTU数量对其影响较大,稀有OTU也就是相对丰度很低的微生物种类; Abundance: 基于微生物均匀度(相对丰度)计算距离矩阵,主要决定于样品中相对丰度较高的物种...
论文投稿,为方便审稿人查看和指出文章细节并进行评审,需要将word中的行号调出;
...师我在做泛基因家族分析里面的泛基因列表构建,cd 03.jcvi-pan-vs-genome cat ../01.jcvi/pangene_filter.*.last | grep -v "^#" > last.txt 这一步,由于我的基因组较多,买的云服务器磁盘空间不够,无法运行这一步,就改为find ../01.jcvi -name "pange...
...基因,但样本数只有12个。运行后得到的cluster dendrogram图中的module colors的颜色只能显示出蓝色,但我table(moduleColors)后得到的颜色模块还是很多的。想问下我这个操作是哪里出现问题了呢?万分感谢!
想法是获取拟南芥植物的所有成员序列,然后通过分析获取隐马可夫文件,然后通过该文件在新的物种中获取该物种的一些信息? 以及如何构建隐马可夫模型
根据视频06中28分钟的方式,新建了一个w.sh的文件,然后根据命令去运行,发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5个文件并没有出现的方式,新建了一个w.sh的文件,然后根据命令去运行,发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5个文件并没有出现。...