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问题 老师,请教一下,用gatk call g.vcf.gz格式的文件是,运行中断了,请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑,而不是从零开始呢

文章 Evolview:制作图例

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文章 vcftools过滤指定缺失率的变异位点

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文章 Gene ID、Gene Symbol、UniProtKB等ID的转换你会么?

我们在做数据分析时,经常会遇到不同数据库的基因ID不统一的情况,为了方便后续的数据分析,需要进行基因ID或者名称之间的转换。今天小编就给大家介绍几个在线转换的网站。 Uniprot基因ID/名称转换方法1、打开uniprot网站,...

问题 cytoscape绘制网络图

cytoscape的conet绘制OTU网络图时,我想查看耐药基因与微生物群落co-occurrence关系,可以把耐药基因丰度作为环境因子录入吗 培训视频里介绍conet处理数据时最大数据量是5000,数据量更大的情况下怎么办?

文章 ggplot2主题theme参数

...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,...

文章 linux中查找包含指定内容的文件

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文章 GWAS根据遗传率和QTL的数量产出模拟表型数据

Table S1. Example of R script that was used to simulate a trait, having Heritability=60% and number of QTLs=20 (H60_Q20), using the marker data of 31,260 SNPs for 346 soybean accessions. #Read Soybean Genotype data fileD<-read.big.matrix("GN.txt", type="char", sep="\t",head = TRUE)dim(D)D=D[,2...

文章 GATK4进行变异检测是否可以多线程

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文章 Linux sort命令使用-g对科学记数法/e记法进行排序

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文章 微生物PCA分析和PCOA分析差别

...义: 主成分分析PCA(Principalcomponent analysis)是一种研究数据相似性或差异性的可视化方法,采取降维的思想,PCA 可以找到距离矩阵中最主要的坐标,把复杂的数据用一系列的特征值和特征向量进行排序后,选择主要的前几位...

文章 Monocle2|单细胞测序的拟时序分析

...系。 拟时序分析 为了方便大家能高效快捷的对单细胞数据进行拟时序分析,我们给大家提供一个R脚本,这个脚本只需要准备好相应的输入文件,再进行简单的命令行操作即可进行拟时序分析并绘制可直接用于文章发表的图片...

文章 《基因家族分析实操》直播培训(第二期)火热报名中!

...件分析;6. 家族内基因表达模式分析(结合转录组或QPCR数据); 从难度上看,掌握基因家族分析内容并不是很难,真正的阻碍是你的犹豫不决,当你还在徘徊时,别人的论文已经见刊了,心动不如行动,想学的赶紧来参加组学...

问题 测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?

测序公司发来的是组装好的测序结果,其中里面有全基因组的序列(fa格式),这用组数据可否进行“基因组重测序分析”课程中讲的snp,indel,sv等分析呢?

文章 最全泛基因家族分析内容思路都在这里了!

...家族分析内容1. 基因家族鉴定与分类内容:基于泛基因组数据,鉴定目标基因家族成员,区分核心基因(所有个体共有)和可变基因(部分或单个个体特有)。意义:明确基因家族在不同个体/物种中的保守性和多样性。2. 系统...