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文章 快速解读:3-5分的蛋白质组学文章思路

...么是转录组测序? 转录组广义上指在某一生理条件下,细胞内所有转录组产物的集合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主...

文章 快速解读:3-5分的蛋白质组学文章思路

...么是转录组测序? 转录组广义上指在某一生理条件下,细胞内所有转录组产物的集合,包括:mRNA、ncRNA、rRNA等;狭义上指所有mRNA的集合。 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,主...

文章 GATK ERROR MESSAGE

...来在网上查了一下了问题可能是参考基因组序列文件编码格式有问题。然后我试着改了一下: 在linux上用cat命令输出参考基因组序列文件,并重定向到新的文件。 cat Donkey_Hic_genome.20180408.fa > Donkey_Hic_genome.20180408.fa.bakmv Donkey...

文章 rocks7 SGE任务管理配置

...机qconf -sel    显示执行主机列表qconf -ah hostname    添加管理主机qconf -dh hostname    删除管理主机qconf -sh    显示管理主机列表qconf -as hostname    添加提交主机qconf -ds hostname    删除提交主机qconf -ss    显示提交主机列表qconf -ahgr...

问题 容器没有了怎么办,怎么挂载

文章 二倍体杂合基因组组装策略

...度信息和contig之间的同源性做杂合contig的判断。该思路的软件:Purge_haplogs、Purge_dups等;第二种基于contig自身比对相似性覆盖度情况,来判断contig是否需要保留,同时会结合其他信息。如HapSolo会结合BUSCO信息进行判断。 第一种...

文章 TCGA数据挖掘生物信息文章(肺鳞癌)

...出11个预后关键lncRNAs。它们的相互作用蛋白参与DNA修复和细胞增殖。对特征lncRNAs进行聚类分析并建立分类模型,最终选择了一个稳定性和真实性都很高的4-lncRNA模型。 参考文献:https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/21691401.2017.13663...

文章 解决Rstudio Server卡顿问题

在使用Rstudio Server出现卡顿,这是因为每次打开Rstudio server时都会加载之前的工作。如果之前运行R代码使用了大量运行内存Rstudio会缓存大量数据,下次登录Rstudio加载缓存可能导致卡顿。 建议每次分析完数据保存好结果后,重...

问题 老师,你好。在做有参转录组分析,准备的文件有基因组注释文件gtf,cds,pep(其中cds,pep都是fasta格式的序列文件),命令如下。其中第一个截图是参考pep文件,比对率为0,;第二个结果是参考cds文件,比对率为57.81%,比较低,这是哪里出了问题吗。另外所以准备的文件应该是cds文件而不是pep文件是吗

# 对基因组构建HISAT indexecho "Step1: build reference index "hisat2_extract_splice_sites.py /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/Yangtao2.coding.gene.V1.0.20190227.gtf > /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/splicesites.tsvhisat2_extract_exons.py /bioData/run_data/lixp/work/G...

文章 一大波三代文章正在来袭!有没有你滴?

...个性化分析,求人不如求己,一切痛点都能解决: 1. 单细胞/空间转录组正在大火,高分文章必备,0基础学单细胞/空间转录组分析,做更牛的个性化分析,绘更漂亮的图,点这个链接:单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...

文章 毕业没那么容易!复旦大学清退12名研究生,其中9名是外籍留学生...

...来看,里面大部分人应该是外籍留学生,而且专业以工商管理为主, 其实说白了,一个歪果仁,来我国修工商管理专业的研究生学历,多半是混日子的, 他们无一例外是由于学习年限届满仍未达到毕业或结业要求而被退学, ...

文章 R语言绘图-绘制漂亮的数学公式或者拉丁字母等在图当中

...上图中奇数列是字符串(表达式),偶数列(蓝色)是Tex格式化的图形。除了上表列出的规则外还有一些拉丁文和希腊文符号,可以在表达式中用 symbol 函数或名称(如alpha)等表示,可参考这里:R表达式。如果函数名(包括运...

问题 请问我在我的笔记本电脑上安装完Docker之后,一直显示无法正常拉取镜像是什么原因?

Dcoker无法拉取镜像最可能的原因是不是网络连接不到外网的Docker Hub?我的网络是国内一所大学的校园内的网络,校园网管理比较严格,严格限制学生访问外网。

文章 某网络小说作者:我要去发篇Nature了,小说停更。。。。

...ntal Cell Research IF: 3.309 中国来源稿件:47.45% 肿瘤学(3区)/细胞生物学(3区) 版面费:选择非OA不付费,OA则需付费 平均审稿周期:6.5周,在线出版平均9周。 需要注意的是,杂志特意声明,偏好实验类的文章(细胞、器官、动物模...

文章 Mapman对表达数据进行聚类分析

...:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 ...