...说明书 1,neighborhood_on_chromosome: 这个特征表示在基因组中,两个基因是否靠近彼此,通常使用染色体上的物理距离来确定。如果两个基因在某些物种中距离非常接近,那么它们被认为是相邻的。 2,gene_fusion: 这个特征表示两个...
像图片中的生长素的通路过程,但是在mapman 中没有这两种激素的下载信息,网站上也没找到,请教一下各位大神,有知道的没?希望不吝赐教,万分感谢!
如何从某一个文本文件中随机抽取一部分数据。譬如右下方这样的基因表达量数据的统计文件ref_trans_full_table.xls目标是由此文件中随机抽取一部分数据。 1、可以利用shuf获取随机数据,譬如随机选出其中的10个基因:(先获取...
Error: Insufficient values in manual scale. 22 needed but only 19 provided.
...于一篇21年发表的马铃薯 NRAMP 基因家族文章,在该篇文章中,作者共鉴定了包括马铃薯在内6个物种(马铃薯、拟南芥、番茄、辣椒、水稻和烟草)的共48个NRAMP 基因家族成员,并通过转录组分析对5种重金属(Pb2+、Cu2+、Cd2+、Zn2+、Ni2+...
按照课程操作选择后产生的点和边数与课程不一致,我的Cytoscape版本为3.9.0
MCScanX 使用中需要的gff比基因组的gff更为简略,请问是否有相应脚本可以生成?或者有什么方法可以制作这个gff呢?
比如在下图中brown模块与weight性状成正相关,意思是指brown模块中基因在weight性状中表达量是上调的吗?brown模块与glucose-insulin性状成负相关,意思是指brown模块中基因在这个性状中表达量是下调的吗? 请老师具体解释一下正负...
如何从海量高通量测序数据中筛选出目标数据?这是困扰大多数老师的一个难题! 以转录组为例,想要挖掘数据,首先要看得懂数据,这是基础。 接下来小编以一个excel的简单函数为例,演示一下如何从表格中快速筛选感兴趣...
蛋白质组实验设计中,会因为样品数原因,会出现搭桥设计,什么事搭桥?什么样的样品需要搭桥?
...m 和 eulerr,每个包都有其独特的优势和适用场景,但是其中很多包在处理大量数据的时候都存在一个显著的问题,那就是出图的速度很慢,主要原因是R包计算交集的时间复杂度高:对于 n 个集合,如果每个集合有 m 个元素,算...