5 mapman 中如何添加 生长素 乙烯 激素的 合成转运的pathway?

attachments-2018-08-C2j2pv3u5b87aef577df2.jpg像图片中的生长素的通路过程,但是在mapman 中没有这两种激素的下载信息,网站上也没找到,请教一下各位大神,有知道的没?希望不吝赐教,万分感谢!

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2 个回答

Daitoue

这种网站上没有的pathway,一般都是自己利用mapman做的

1、准备好比较清楚的图片png 作为通路图

2、按照mapping文件格式去准备mapping文件,文件中对应你准备map到该图片上进行标注的所有基因,并给定 bin  编号,相关描述等,导入mapman的mapping中,

3、在mapman 的pathyway部分选择add pathway,导入图片,在显示区图片需要进行map的位置,通过右击->add增加bin 编号,注意和你的mapping文件中的bin 编号一致,方便该基因的表达数据能在该位置显示。

4、结合你的表达数据,图片及设置的pathway,mapping文件绘图

中间就是比较细节的调整和设置过程了。希望对你有帮助



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fang

好的,谢谢您!我按照您的方法试一下,自己画一个。

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