...数据里是有4组，并非treatment/control两组而已，无重复，四个独立组，出DEG时，只选其中两个，不考虑其他两组。然后发现，在软件GSEA，因为要上传cls文件，提供组别信息，如果我不把四组列出来，只列我想比较的两组，跑出来...
...高的植物，茶树（Camellia sinensis L.O. Kuntze）就是其中的一个典型代表。下面就来介绍一篇利用RNA-seq研究茶树Al耐受性机理的文章，告诉大家它的成长真不容易！ 预实验确定RNA-seq取样点 分别在0、100、200、400、1000 μM Al浓度下...
...曰“工欲善其事，必先利其器”，学习生信怎么能不配两个屏幕呢！一竖置屏，一横屏更是完美搭配！ 那么电脑设置双屏显示或多屏显示有什么用？怎么设置双屏或多屏显示呢？下面小编简单介绍一下它的作用以及具体的操作...
在提取miRNA前后500bp序列时，若没有其位置信息，提取会比较麻烦，可用以下方法提取： 1.首先利用blast软件将miRNA的前体序列与基因组比对，获取前体序列的位置信息，比对方法： makeblastdb -in Donkey_Hic_genome.20180408.fa -dbtype nucl -t...
...一个包含多列数据的文件 data.txt A 2565 301298 0.69% B 50 83602 0.19% C 3568 2710730 6.23% D 16 9837 0.02% E 5 891 0.00% F 3669 2822554 6.50% 如果你想要为第二列和第三列的数据添加千位分隔符，...
...下载数据时报错。详细的更新信息参考TCGA官网说明： https://docs.gdc.cancer.gov/Data/Release_Notes/Data_Release_Notes/#data-release-320 这里提示几点重要更新： 例如：转录组之前HTSeq流程的数据，现在是STAR-Counts的数据。 受到影响的主要是...
...。 3、鱼骨图分析法 5M因素包括人、机、料、法、环5个方面： “人”指的是造成问题产生人为的因素有哪些; “机”通俗一点就像战斗的武器，通指软、硬件条件对于事件的影响 “料”就如武器所用的子弹，指基础的准...
...数)或缺失(减少拷贝数)。这些变异可能覆盖几千到几百万个碱基对。而肿瘤恶性细胞通常伴随着拷贝数变异，通过影响相关基因的表达促进肿瘤发生。在肿瘤单细胞转录组数据分析过程中，肿瘤细胞类型的注释可通过tumor related m...
很多同学会有这个疑问：做生物信息分析对笔记本电脑要求高吗？我的笔记本够用吗？ 贵的笔记本性能就一定强吗？ 我发现目前网上这方面的信息很少，甚至还有些生信大V做错误的高中低配笔记本推荐，点进去一看“中配”...
...明。 那如何来查找这些基因呢？这就要用到OrthoMCL这个软件了。 OrthoMCL介绍 OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/) （v2.0版本）是现在用的最多的一款来找直系同源基因（Orthologs）以及旁系同源基因 (Paralog) 的软件。 根据官网的...
来源：科学网 作者：施一公 作为一个科研工作者，在国际学术期刊上发表科研论文是与同行交流、取得国际影响的必经之路。有些国内的科学家，实验做得很漂亮，但常常苦恼于论文的写作力不从心，成为国际交流的一大...
... 接触和分析过TCGA数据的朋友肯定会经常处理TCGA barcode的7个编码信息，每个编码信息用横杠-隔开，如下所示： 第一次分析TCGA数据看着这么长的样品编号感觉很是难以理解(例如：TCGA-3M-AB46-01A-11D-A410-08,TCGA-3M-AB47-01A-22D-A410-08,TCGA-B...
一、什么是DoD？ 当你有两个或更多的人参与同一个事情的时候，我们的“团队”就产生了，这时我们最重要的事情，就是要设定和统一团队的期望值，在本文中，这就是“完成标准”。 一个迭代做完后，团队要进行验收...
请问我想以（）为分隔符，提取GO number，先用sed 's/(/\t/g' | 命令把（）替换了，然后发现不对 还有一些不需要替换的，我就不知道怎么判断了。请老师指教
...2010 ），输入需要分析的数据，本次演示的数据是温度和PH值对水稻种子萌发率的影响。在这里，我们没有设置重复，属于无重复的双因素方差分析，具体如下图所示（数据为模拟之用，并非真实）。 03 点击“数据分析”选...