...数据的探索，可以允许跨gene，样本和数据类型的可视化分析。用户可以可视化一个癌症研究中多样本间基因改变的模式，并比较点多癌症研究中gene改变频率，或者在一个个体肿瘤样本中总结概括所有的相关的基因组改变。这个...
...ol是这样子的XLOC_l2_007835，XLOC_l2_015212这些是什么东西？也不知道它是不是基因，可不可以把它去掉？还有gene sybmol里面有些lincRNA是这样子的lnc-RP11-778D12.2.1-5 这样的拼写是对的吗？
如上图，输入sft代码后，没有给出合适的powerEstimate。我根据R2值不小于0.8，slope值接近-1，平均连通性尽可能大的原则选择了power值等于7，是否合理？根据图中的数据，本次数据是否适合做WGCNA的分析，结果的可靠性高吗？
...er中。求老师解答~~（还有具体步骤） ps：服务器的Linux版本是centos7
...验正是以t分布作为其理论依据的检验方法。后面的方差分析，其独立样本T检验的前提条件是相同的，即正态性额方差齐性。(参考：t检验和方差分析的前提条件及应用误区_百度文库（链接见文末）说的非常详细) 2.分类 单总T...
扩增子分析视频课程推荐：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF 微生物多样性分析中，常常需要对微生物群落功能进行注释，FAPROTAX数据库方便简单效果好，一行代码即可生成功能注释表，今天就给大家介绍该数据库内容及使用方法。 ...
...，没有收录在在Ensembl数据库，所以我是在川桑数据库下载的genome，gene，cds及protein。如下图 然后在NCBI上下载了川桑的GFF注释文件，如下图 老师，下图是我根据视频学习找到的基因ID然后运行perl脚本get_gene_weizhi，得到gene_weizhi...
分别使用wilcox和t检验判断结构变异和非结构变异WRKY的表达量是否具有显著的差异 进行如下代码后报错 Rscript $scriptsdir/compare_stat_boxplot.r -m fpkm_SV_to_draw.2.txt -g SV -v value -b ID 对输入文件有进行去重复，仍然报错，我的输入文件有...
经常有小伙伴做基因家族分析时遇到gff里面的mRNA ID与蛋白或者cds 序列 ID不一致的问题： 导致程序报错 例如下面玉米的GFF里面的mRNA ID和基因组基因蛋白序列的ID不一致的问题； 一劳永逸的彻底解决办法是，自己根据GFF信息...
...缺铁培养基中Ga(NO3)3对不同菌株的最低抑菌浓度（MICs），分析Ga（III）对野生型（WT）和不同PAO1突变体生长的影响。他们还分析了不同的铁吸收途径对PAO1和PAO1Δtesf突变体摄取镓的影响。在这个双突变株中也观察到细胞内铁水平...
...和HMMER筛选出187个符合条件，但是将其fasta文件提交至SMART在线数据库有多达42个是no match，请问那是把找不到的删除掉吗？还有就是我所选择的基因家族包括两个亚族，两个亚族下面有分为12组，我怎么确定我筛选的一百多个基因...
@小兰老师：您好！我按照《基因家族分析》视频课程学习第四课时，准备NB-ARC 的hmmer文件，运行结果domain.fa出现了输出结果为空，使用editplus 打开还是为空。请问是不是script 运行出现问题了？因为我看不懂perl 但是从课时4中下...
...外人看来一脸黑人问号的梗，在我们眼里也是心领神会、不言而喻...... 以下这些，不懂不是科研汪！！ 1、自我介绍 不要问我为什么辣么那么穷，没错我就是个科研搬砖民工， 你以为读了硕士读了博士就是搞科研吗? 见过...
TWAS的分析原理 人类复杂形状的出现很大程度上可以归因于遗传变异，但遗传变异对于性状的作用机制却尚不明确。许多遗传变异通过调节基因表达来影响复杂性状，即改变一种或多种蛋白质的丰度。有人认为这种关系可以通过...
...（三角对应miRNA，圆点对应靶基因）： 1、根据其他的分析，例如基于注释，将靶基因所属的pathway列举出来： Target pathway AT1G65440 A AT3G06340 A AT5G58220 A AT1G08590 A AT1G19800 A AT1G72700 A AT1G80680 A AT2G02090 A AT2G40316 ...