...、集成测试、系统测试等阶段才能发布，这一过程少则几个月半年，大型项目周期长达1年甚至更长，软件的价值在全部做好之后一次性交付。现在VUCA时代(商业和外部环境充满了易变性，不确定性，复杂性，模糊性)等到产品或...
...毒基因表达系统由用于表达特定基因的目的质粒及病毒 gag/pol、Rev 和 VSVG 等组分的包装质粒组成，其中包装质粒提供了病毒基因组 m RNA 包装成完整毒粒所必需的结构蛋白、聚合酶和包膜蛋白。 HIV-1是慢病毒中最具特征性的病毒...
... 下面是我的樱桃dna.fa文件： 综上，我的问题有2个： 1. gene_weizhi.txt第二列并不是某一条染色体，我想是我的樱桃基因组数据组装的原因，我想请问，这种情况还能继续往下做分析吗？第二列数据是代表什么呢...
...保存并退出 二、跳转到指定行 1.在正常模式下输入ngg 或者 nG，n为指定的行数； 如输入 100gg 或者 100G 跳转到第100行. 输入 gg 跳转到当前文件的第一行 输入 G 跳转光标到当前文件的最后一行 2.在命令模式下输入行号 :n ...
...对应差异表达分析获得的差异对比组之间基因表达变化log2FC A可以利用差异对比组的FPKM进行计算，以R和G来表示差异对比组的话，可以取R组基因的平均FPKM和G组基因的平均FPKM进行计算。也包括多个R包可以实现MA图绘制: affy (ma.pl...
大家都知道GSDS自带了一个绘图编辑软件（下图红框），使用这个软件可以对我们图片不满意的地方进行修改。 但是这个软件有个问题，是它不能导出矢量图。 选择导出PDF格式后，就一直让等待，就像下面这样，一直也加载...
使用方法： usage: tcga_gene_exp_download.r [-h] -p project [-f files.per.chunk] [-o outdir]TCGA 基因表达数据下载及临床数据下载与整理，详细帮助见:https://www.omicsclass.com/article/1485optional arguments: -h, --help ...
...一下，谢谢 # 以logFC>1，Qvalue<0.05为阈值进行过滤up <- subset(DEG1, adj.P.Val < 0.05 & DEG1$logFC >= 1)down <- subset(DEG1, adj.P.Val < 0.05 & DEG1$logFC <= -1)
使用方法: Rscript network.r -h usage: network.r [-h] -e filepath -v filepath -f from -t to -w weight -g group [--isolated] [-l style] [--label.node] [--sub_label.node] [-o path] [-n prefix] [-H number] [-W number] network plot:https://www.omicsclass.com/articl...
...只选用丰度大于0.01的物种用于绘图，数据如下（列名A、B、C为样品，行名Acetobacteraceae等是科一水平的物种分类）： OTU A B CAcetobacteraceae 0.506365321669611 0.596887241236994 0.45752814...
...tions, CNA)，例如整条染色体或大片段染色体的增加或丢失(gain or deletions)。工作原理是，以一组“正常”细胞作为参考，分析肿瘤细胞基因组上各个位置的基因表达量强度变化，通过热图的形式展示每条染色体上的基因相对表达量...
...类型包含多个异质亚种群动态情况下。Stochastic model 旨在更好地捕捉稳态。通过将转录、剪接和降解视为概率事件，由此产生的马尔可夫过程近似力矩方程。其中包含二阶矩，它不仅利用了未剪接到剪接 mRNA 水平的平衡，而且利...
...dir 10.assembly_hifiasm cd 10.assembly_hifiasm hifi=$datadir/dujuan_output.fastq hifiasm -o hifi.asm -t 8 $datadir/dujuan_output.fastq #get primary contigs in FASTA awk '/^S/{print ">"$2; print $3}' hifi.asm.bp.p_ctg.gfa > hifi.asm.bp.p_ctg.fasta 这是运行代码
老师就是这个阈值计算，您的R里面需要提供3个参数，能否指导下这三个参数分别是什么呢？或者有没有示例数据和代码呢？这个我研究了好久都没搞懂 谢谢老师！
...d) = split(/[\:\-]/,$line[2]);while(my($key,$value) = each %region){my($a,$b,$c) = split(/[\:\-]/,$key);next if($a ne $chr);print "1\n" if($line[0] eq "BjuB010898");if(($start >= $b) && ($end <= $c)){print OUT $_;last;}}} 主要就是在一个循环中使用while和each遍历哈希，...