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文章 Bugbase表型预测

...DY_SITE），提交数据即可。 2、本地使用 下载QIIME1镜像：docker pull omicsclass/ampliseq-q1:v1.2（镜像里安装好运行所需的所有R包） 在本地文件夹 D:\project\bugbase 中放入号准备的文件： 进入镜像：docker run --rm -v D:\project\bugbase:/work -i...

文章 空间转录组实操课程

...图表为发表级，可以直接用于文章撰写；3. 分析环境基于docker一键搭建完成，解决了各种生信软件安装的烦恼； 4. 所有代码封装，可快速批量运行，简介高效。 5.从原始数据到分析结果，采用同一套示例数据连贯讲解，不像其...

文章 illumina平台转录组299/样品，组学大讲堂学员专属福利！速来报名吧！

...： ①课程针对0基础学员设计，半自动化分析； ②采用docker虚拟机技术，不同操作系统保持一致分析步骤； ③云服务器上教学，避免电脑性能不足； ④提供回放视频，两年内可反复学习； ⑤问答社区解决售后技术问题。 ...

文章 Win10家庭版也可以装Docker桌面版了！

...信学习爱好者方便快捷的使用linux系统，推出了不少关于docker的使用教程（包括推文和视频教程）。然而，由于大多数的个人电脑系统是win10家庭版系统，这就导致无法安装Docker Desktop版本，只能选择安装步骤繁琐的Toolbox版本。...

文章 windows10中基于WSL2的docker镜像存储位置更改

Once I started playing with Docker on Windows it quickly turned out that latest version heavily rely on WSL 2, in comparison to an older Hyper-V based approach. One thing that changed significantly during this technology transition was lack of a setting screen to actually define the location (and...

文章 STAMP使用（组间差异）

...易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1.docker 生物信息工具安装 2.OTU网络图 3.R 语言入门与基础绘图 4. 转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言...

文章 泛基因组可视化

...-s /work/ara_pangenome/pangenome* .#启动服务可视化。记得启动docker时加上端口映射 -p 3000:3000 cd /share/work/biosoft/sequenceTubeMap/sequenceTubeMap  npm run serve  #启动服务启动服务之后，打开电脑网页，输入运行这个服务的IP地址加端口号：h...

文章 win10 安装最新的基于WSL2的docker

...建用户帐户和密码。  注意使用英文的账号密码：4 安装dockerDocker Desktop for windows方式Docker 也专门开发了可以使用 WSL2 中的 Docker 守护进程的桌面管理程序, 打开 Docker Desktop WSL2 backend 页面，下载最新的 Docker Desktop for Windows 程...

文章 远程服务器登录putty（云服务器，实验室服务器等）

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 组学大讲堂QIIME2(v1.5)镜像更新说明

...析的绝对分析标准。 我们组学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像（v1.4）使用的qiime2 版本为：Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8，相较于2020.8版本有很多大的更新，更新信息如下： 扩增子docker镜像更新说明 为使大家...

文章 Samtools截取基因组序列（Docker篇）

...省去繁琐的安装步骤而直接使用samtools呢？答案是有的！Docker工具可以完美的解决这个问题！ Docker是生信初学者必不可少的工具，具体介绍参见文章：生物信息软件安装解决方案-docker虚拟化技术。Docker工具下载安装请参考：Dock...

文章 EggNOG基因序列批量注释

...ggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd  eggnog_proteins.dmnd 2）利用docker工具搭建EggNOG-mapper注释分析环境，以拟南芥为例： #下载安装eggnog的docker镜像 docker pull omicsclass/eggnog:latest #启动镜像 #注意这里的 -v 使用了两次 docker run --rm --cpus 8...

文章 轻松下载k8s.gcr.io，gcr.io，quay.io镜像

一.系统环境CentOS Linux release 7.4.1708 (Core)Docker version 20.10.12x86_64二.前言在云计算和云原生的环境下，不可避免的会使用很多镜像创建容器，其中有些镜像只有谷歌镜像仓库才有，但是国内不可以直接下载谷歌仓库的镜像，下面推...

文章 biolinux虚拟机安装指南

...大讲堂不再支持vbox中的biolinux，转向用更好的虚拟机工具Docker，学习安装使用课程见： https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0   更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接...

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

Docker可以支持在mac、windows、linux上安装。在windows上安装要求版本：64位Windows 10 Pro、Enterprise或者Education版本。不过，其他版本win7，win8 win10 家庭版等，可以使用Docker Toolbox作为替代方案。文后有讲解 视频课程：docker安装视频课...