按所上传图片的第二种方法提snp,似乎不能49个样并行运行提snp，而是运行一个之后才能运行另一个样，速度非常慢，这是为什么？

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 6小时前

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

红框框里面生成的bash命令是顺序执行，一次执行一条，结束了执行下一条，
如果需要并行可以使用下面的命令,表示每次并行运行4个任务：

ParaFly -CPU 4 -c 3.1.2.gvcf.sh

call SNP 费时间速度慢正常的，还和你的计算机性能有关，耐心等待