镜像和脚本是配套的,不用在容器里面更改R包。可以检查一下镜像和脚本,重新开一个容器运行尝试一
老师我在做基因家族成员选择压力分析时,得到了all_kaks之后,下一步该绘制kaks密度分布图,使用脚本Rscript /work/scripts/kaks_plot.r -i all_kaks -p kaks --xlab ka/ks --min 0.05 --max 3 -H 10,之后会提示如下错误,
尝试安装包时候出现错误# 设置C99标准并重新安装所有必要包
CFLAGS="-std=gnu99" CXXFLAGS="-std=gnu99" R -e "
install.packages(c('ggplot2', 'ggsci', 'viridis', 'dplyr', 'tidyr'),
repos='https://cloud.r-project.org/', dependencies=TRUE)
"
一直安装不成功,这个分析之前做过很多次(由于反复修改数据),都没有出过问题,请问是什么问题呢,该怎么解决?