老师您好。我的基因家族成员通过PSI-blast比对结果只有部分的基因家族成员有结果,且运行python3时没有结果。是不是我只能通过swiss-model找模板预测结构。如果通过swiss-model得到模型,是不是就不能再用pymol计算RMSD值了?
最后,像我这种情况是不是就只能用氨基酸序列通过swiss-model得到模型。然后在通过第三方软件看评分就可以了。
通过swiss-model得到模型,可以将模型和用的模板下载下来在pymol计算RMSD值。Python 得不到就用swiss-model方法,也推荐学习一下AlphaFold方法:https://zhuanlan.zhihu.com/p/699907182