蛋白3D结构预测

老师您好。我的基因家族成员通过PSI-blast比对结果只有部分的基因家族成员有结果,且运行python3时没有结果。是不是我只能通过swiss-model找模板预测结构。如果通过swiss-model得到模型,是不是就不能再用pymol计算RMSD值了?

最后,像我这种情况是不是就只能用氨基酸序列通过swiss-model得到模型。然后在通过第三方软件看评分就可以了。

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1 个回答

rzx

通过swiss-model得到模型,可以将模型和用的模板下载下来在pymol计算RMSD值。Python 得不到就用swiss-model方法,也推荐学习一下AlphaFold方法:https://zhuanlan.zhihu.com/p/699907182

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  • 生信小白 提出于 1天前

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