基因家族分析环境变量

请问:

1.通过docker进行基因家族分析,是不是每次退出终端都要exit。然后再次进入终端后,先要设置环境变量workdir=/work/my_gene_family

scriptsdir=$workdir/scripts/。

2. docker image ls 查看后台镜像显示有“omicsclass/gene-family v2.0”是不是就可以进行基因家族分析了

3. 为啥我运行shell文件中提供的“保留蛋白编码基因 agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3”,ctrl C终止不了,没有反应。

请先 登录 后评论

1 个回答

rzx

1. 通过exit退出后容器会被删除,之后启动 基因家族分析镜像 进入到 新容器 才需要设置环境变量 。如果换一种退出容器的命令ctrl+shift+p+q 会保留当前容器,之后进入这个容器是不用重新设置一遍环境变量的。参考笔记:https://note.youdao.com/coshare/index.html?token=9B53FC154F7740E1AF0B452387E9898C&gid=92990402&_time=1689992604406

2. 是的

3. 如果在命令行提示符后光标没有反应,可以等一会儿,也可以杀死命令重新投递。

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,37 浏览
  • 生信小白 提出于 1天前

相似问题