老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Zj --cscore=0.7这一步出错,换下一个物种生成anchors文件为空,请老师指点

老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH Zj --cscore=0.7这一步出错,换下一个物种生成anchors文件为空,请老师指点attachments-2018-12-x0iw7l2u5c24b30c04c12.jpgattachments-2018-12-WnCFNOsk5c24b313cb741.jpgattachments-2018-12-phCqTdN85c24b31899ed8.jpgbed和cds名字也都一样attachments-2018-12-0nAGMdkc5c24b371c1a1f.jpgattachments-2018-12-c1GX9L9w5c24b3759bf61.jpg

请老师指点,谢谢

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最佳答案 2018-12-28 11:56

看文件格式输入没有问题,检查Pt.bed文件ID找不到:

1.检查bed文件除了tab空白是不是还有空格

2.检查文件名字是否正确,Pt.bed  Pt.cds

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  • clcprince 提出于 2018-12-27 19:12

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