进化树结构与预期不符解决办法：
1.调整序列比对结果，trimAL 参数调整
2. 构建进化树的方法换一下试试，NJ，ML等
3.如果是ML法，选择的核算或者氨基酸的替换模型可以换一下试试
建议看看进化树构建原理，希望对你有所启发：https://www.omicsclass.com/article/2010
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