发现 问答
发起
  • 提问
  • 文章
文章
更多
  • 专家
  • 讲堂
  • 话题
  • 财富榜
  • 商城
  • 首页 (current)
  • 问答
  • 文章
  • 视频课程
  • 话题
  • 商城
搜索
  • 登录
  • 注册

GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来,检查很久都没有解决问题,麻烦老师进行解答。

  • GWAS


attachments-2023-12-yLfsLO5F656978e6bd385.png

  • 0 条评论
  • 分类:遗传进化
请先 登录 后评论
默认排序 时间排序

1 个回答

Chen jie yang xi rêve
Chen jie yang xi rêve 2023-12-01 16:10

已解决,需要在04.LDdecay中建立一个popid.txt文本文件,里面包含所有样品名称attachments-2023-12-aQkvlRgs656994f1b41e9.png

  • 1 条评论
请先 登录 后评论
您需要登录后才可以回答问题,登录 或者 注册
  • 1 关注
  • 0 收藏,1911 浏览
  • Chen jie yang xi rêve 提出于 2023-12-01 14:09

相似问题

  • tassel导入表型数据和Q文件,一直报错格式有误 0 回答
  • tassel导入表型数据和Q文件,一直报错格式有误 0 回答
  • 全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题 1 回答
  • GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题 2 回答
  • 老师您好,针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到:你这个数据里面是不是P值有0的情况,取了对数就无穷大了,导致出问题。但是,我发现里面没有P值为0的情况,那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢?需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢?还有,我发现P-Value的原始文件有NaN的情况,是什么原因呢?是否对GWAS有影响呢? 1 回答
  • GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题 1 回答
组学大讲堂问答社区| 联系我们: 010-80543251  tech@biomics.com.cn| 京ICP备16017673号-2| sitemap

发送私信

举报此文章