关于动植物基因组组装课程mysql_server.sh

课程中myseql镜像是用docker启动的(如下),但是如果用singularity启动,相关的命令参数如何更改?我能查到的是-v对应singularity中的-B,其它-p  --name  -e  -d 该如何修改?


mysql_server.sh脚本文件中:

#启动镜像

docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \

-v $PWD/log:/var/log/mysql \

-v $PWD/data:/var/lib/mysql \

-v $PWD/conf:/etc/mysql \

-e MYSQL_ROOT_PASSWORD=123456 \

-d mysql:5.7


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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

singularity 用不了mysql;   

更改PASA配置文件用sqlite  数据库,课程里面有讲的;

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cashing

为什么singularity 用不了mysql ?

用sqiite数据库的话,其结果和用mysql数据库有差异吗?

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  • cashing 提出于 2023-03-08 22:19

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