二代测序和三代测序做转录组有什么区别？

导师让做点转录组看看样品的表达差异，听销售说有二代、三代技术，这两有什么区别呢？

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1 个回答

omics007 2019-06-26 09:50

二代转录组目前来说就是illumina测序仪做的，价格便宜，读长短（一般是PE150），但是reads数量巨大，6G数据量就有2000万的reads了，适合用来做表达定量。

三代测序，目前两家主流的是PacBio和nanopore，价格远高于二代测序，优点是读长长，适合用来获取全长基因或者研究基因结构，但是reads数量一般，用来做定量的话，不是很合适。

既然你是想看样品的表达量，那做二代测序就行了。