老师,我在重新描述一下问题,mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对,数目不一样,是不同算法的不同结果是吗?做CIRCOS圈图时, 可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗?我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

blast方法只能找到串联重复的基因,大片段复制的基因无法判断;

你看看定义概念,还有视频课程;https://www.omicsclass.com/article/730

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