10 同一物种不同基因组(已经组装好)之间可以call snp么

最近需要做BSA分析(EMS诱变),有两混池的测序数据,实验室有组装好的野生型和突变体背景基因组。好像ED法只需要混池数据即可,snpindex则还需要亲本数据。我想两种方法结合使用,有这方面的大神嘛

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

建议用野生型基因组作为参考基因组call SNP

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