请问如何从无参转录组的fasta数据中,找到一些拟南芥的同源序列,比如拟南芥的LHY基因,在fasta数据中能找到吗

upup

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2 个回答

生信老顽童

测序数据是短片段的序列,你可以通过比对看出哪些序列比对上了你的目的基因。不过最好建议你拿你的目的基因和无参转录组组装得到的unigene进行blast,比对率高的可能就是同源基因。

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Jackeylove

attachments-2020-08-JimigclD5f3a5faaca865.pngattachments-2020-08-fUaLUuSM5f3a5fa283441.png谢谢老师您的解答,我还有个问题,为什么我下载咱们课堂的的bio-linux共享文件,总是挂载不上,用原来的官网的就可以呀

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