MCScan共线性分析画图问题:list index out of range

老师您好

我已经找到了我在chr1A,chr1B,chr1D上同源的一段序列,上面的基因也同源,我相用MCScan画这几个基因的共线性图。但是会报错attachments-2020-04-hUEnGQN25e947c30c8d6b.png

我的bed 文件和cds都没什么问题

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3 个回答

空谷临风

我也遇见过,发现染色体按顺序排列后(bed里)就可以运行了

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云的印记

请问你的问题解决了吗?最近我也遇到了同样的问题,能否加下微信,想向你请教一下,我的微信号:ltj1103990748

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

把所有基因ID后面的.1 去掉试试


删除所有文件结尾的空行

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