log2 (FPKM) 画热图

已经有了基因在根、茎、叶中的表达数据,想根据FPKM值来绘制热图。在处理FPKM值时遇到问题:log2 (FPKM) 是指以2为底数,算这个值吗?还是以10为底数,2倍FPKM来算值?请知道的同学或老师帮忙回答一下,谢谢大家~


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

log2 (FPKM)   以2为低的对数转换;和10没有关系;

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