基因组信息文件内容格式

attachments-2020-03-JKd5h7vO5e7ca3b64518e.png老师您好,我在进行基因家族分析的时候遇到一个问题:下载的基因组信息文件内容格式是每条染色体的所有碱基都在一行,也就是只有一行。如图所示。

当我做基因上游瞬时作用元件分析的时候,由于文件太大,防止内存不足,打算将每条染色体的碱基序列分开提取,分开分析。

当运行get fa by id这个脚本后,输出文件没有内容。

我怀疑可能是基因组文件格式问题,请问老师怎么回事?有解决的方法吗?

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最佳答案 5天前

这个也是fasta格式,可以运行的,getfabyid脚本也是可以的,不知道你是不是哪里出错了;

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