求助大佬,想做基因家族分析,目标物种在网上只有三个组装的基因组,JGI上和NCBI其中一个都没有组装到染色体层面,NCBI另一个组装到染色体了,但是没有gff文件和蛋白序列,这种情况应该怎么办?不能做与染色体位置有关的分析了吗?

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最佳答案 2020-03-07 15:31

建议选择组装完整的基因组,最好到染色体水平;

如果基因组上的基因蛋白序列没有,就没法做基因结构域分析了;建议选择注释完整的有GFF,cds,pep蛋白序列的参考基因组;

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  • 小明在做游戏 提出于 2020-03-04 03:10

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