具有两个结构域的基因家族的分析

文献中NBS-LRR基因家族有NBS-ARC和LRR两个结构域(个别的前面还有TIR结构域),我现在下了NBS-ACR和LRR1的HMM模型(LRR有好几个模型),用hmmsearch命令分别搜索结构域,得到了两个结果文件,我想问下老师这两个结果文件是合并起来继续分析,还是分别分析再合并,如果是前者的话改如何合并,后者的话分析到哪个步骤再合并,文献中说的都不清楚

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

建议不用合并分析,以NBS-ARC结构域为准,才是NBS基因,其他结构域只是附带的结构域,可有可无。但是对于基因分类有用。

自己的数据自己分析,关键是自己得有分析思路;

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  • 章鱼哥吹笛子 提出于 2019-10-25 12:23

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