基因染色体定位

在做基因染色体定位时,输出的map_to_RNA文件为下图,只有Contig,没有染色体号attachments-2019-08-joylrujA5d576bf4c2fe7.jpg

输出的fai文件格式为下图,有染色体号,也有Contig号,怎么确定Contig上的基因在染色体上的位置呢?Contig和染色体的对应关系怎么查?Mapchart所需文件怎么做?attachments-2019-08-gFZDRevQ5d576c6760ce7.jpg

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3 个回答

安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

你所有基因家族基因都位于contig上吗?只需要画位于染色体上的基因即可。

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

contig上的基因无法知道在那条染色体

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lotus

我找到了一个描述染色体和contig对应关系的文件,问题解决了

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