关于多因素 cox分析后,gene signature的构建的问题

老师,朋友们,请教个问题,tcga生存分析中,cox多因素分析后,筛选出的显著基因,用predict 功能构建显著性基因组成的风险模型。

1、是根据这个模型对样本算出的值进行高低风险评价,生存分析,以及ROC的吗?

2、predict 预测之后,可以查到样本对应的一个值,这个由若干个基因构成的公式 应该如何查看呢?
3、文献中 说的是 coefficient * 基因值,然后相加,可是我试了一下,这个predict 得出的值并不是 这样的,那这个公式是什么样的?应该如何查看呢?

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1 个回答

microRNA

首先我们来看一下Cox 回归模型:

attachments-2018-08-KGiRh7Gk5b74d67ce3eb7.jpg从公式来看, h(t, X) 与 (X1,X2...Xm) 这些影响因素是线性相关的。 
1.  你采用的是Risk Score 是 后者 

2. 我们课程中用的是前者。 

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