老师您好,我在运行多个基因组共线性时出现报错,mcscan_layout文件里的输入的文件也都正确,在当前目录下,不知道是什么原因

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

上面已经提示了,基因的ID,也就是simple里面的基因ID 在bed里面找不到,你确认是不是搞错了; 

关于多个基因组放在一起绘制共线性,你可以参考这里:MCscan GitHub wiki https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version) , GitHub, June 9th, 2018

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