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空间转录组seurat聚类
Rscript $scripts/h5ad2qs_visiumv2.R --h5ad benihoppe_flower.bin50.h5ad \ -o benihoppe_flower.bin50.qs 我跑这条命令时遇到了以下报错 [root@7933bc764da1 18:46:23 /work/STOmics/02.convert]# Rscript $scripts/h5ad2qs_visiumv2.R --h5ad benihoppe_flower.bin50.h5ad \ -o benihoppe_flower.bin50.qs -->...
回答于 2026-10-11 18:57
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cell_trajectory_monocle3.r脚本使用报错
格式检查过了，没有问题，检查第一列信息的基因ID和我的单细胞里面的geneID是一致。feature ID如何进行检查？我的数据是SCT标准化会有影响嘛？
回答于 2026-07-28 15:54
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ROGUE 判断分群纯度
[root@2924b6180854 10:34:37 /work/benihoppe_flower/03.seurat_cluster]# awk -F'\t' 'NR>1 {print $7}' benihoppe_flower_sct/benihoppe_flower_sct.metadata.tsv | sort | uniq -c 16072 S1.R1.benihoppe 15036 S1.R2.benihoppe 16625 S1.R3.benihoppe 18398 S2.R1.benihoppe 18630 S2.R2.benihoppe...
回答于 2026-06-29 10:44