Daitoue
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老师你好,我看了你多芯片illmina 标准化的视频,用你的代码发现...

应该时文件的问题 默认的应该时以这种表头中涵盖的字符去判断有效信息,案例数据中刚好就是这种,格式上可能出现了问题

回答于 2019-09-02 14:55

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老师您好,请问一下在做双通道芯片标准化时按照课程里的代码,前...

听课程讲解 SampleName是什么意思 怎么来的 检查检查你前面的代码运行结果

回答于 2019-09-02 10:04

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您好,我按照网易云课堂的课程脚本做wgcna分析时,在模块儿与性...

你检查检查前面的结果吧,报错信息已经提示很明显了 xlabels的信息没和Matrix对应

回答于 2019-09-02 09:59

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R分析KEGG报错

确定拟南芥注释包安装完成,确定你的keytype没写错:

回答于 2019-08-30 10:38

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老师您好,想咨询GEO问题

1、绝大部分GEO芯片提供标准化数据,不同芯片类型对应的标准化形式不同 2、若三个实验数据来自同一芯片类型,理论上可以联合分析,注意需要去除批次效应 3、若三个实验来自不同芯片,对应的探针不同,数据无法相互对应。

回答于 2019-08-30 10:35

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agilent双通道芯片数据标准化

保存格式的问题吧,也许你是csv2格式的文件,直接打开这样,但是R语言读进去是正常的 你可以试试用R 读入检查一下。或者你考虑保存成其他格式的文件也可以。

回答于 2019-08-27 10:10

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做KEGG富集分析时,我有已知基因的k number,如何查找该基因的ko...

指的是基因的涉及的pathway id吧,可以把基因输入kegg的网站查询一下

回答于 2019-08-27 09:17

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想问下,甲基化生存模型里的predict函数,输出的风险值,和用hr...

predict函数应该只是获取模型预测结果而已,背后的算法是和模型相关的,至于比较的话 这个需要看背后大量的文献了,这边没有做个这些整理。

回答于 2019-08-24 11:08

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转录组数据下载

转录组标准分析后的数据挖掘 主要是介绍关于转录组标准分析后的相关信息的挖掘 介绍一下简单易操作同时有效的数据挖掘分析方法,如果感兴趣关于转录组原始数据(测序fastq文件)下载之后如何进行转录组分析 可以参考:二代测序转录组数据自主分析

回答于 2019-08-24 11:01

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基因家族

第一个问题:基于你搜索结果选定更好,0.001更准确,但是如果你获得的结果数量较少,在一定合理范围内可以做调整 第二个问题:基于你的分析目标序列特征决定,如果基因家族序列必须包含多个domain 则必须全部搜索取交集,如果仅要求包含其中一个,全部搜索取并集 诸如此类

回答于 2019-08-24 10:57