5 基因家族

基因家族用hmmer筛选时e值用0.01还是0.001比较好,而且我的pfam号有好多个?是要全部都搜索吗?



请先 登录 后评论

2 个回答

Daitoue
擅长:生命科学,生物信息

第一个问题:基于你搜索结果选定更好,0.001更准确,但是如果你获得的结果数量较少,在一定合理范围内可以做调整

第二个问题:基于你的分析目标序列特征决定,如果基因家族序列必须包含多个domain 则必须全部搜索取交集,如果仅要求包含其中一个,全部搜索取并集 诸如此类

请先 登录 后评论
安生水
擅长:perl,基因家族,linux,chip-seq

这个不同基因家族可能不太一样,你最好找一篇相同基因家族的文献,按照文献里的方法做。

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,184 浏览
  • 阿南 提出于 2019-08-23 13:11

相似问题