泛基因家族分析

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将基因组文件和gff文件批量链接到当前文件夹时，文件名出现问号，下一步对gff文件进行处理（保留蛋白编码基因）报错，应该怎么办

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数据准备 检查变量对应有问题

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泛基因家族分析，核心基因等数量统计

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SV与家族基因的保守结构域分析

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泛基因家族分析之基因家族成员选择压力分析

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在PAV分析绘制热图的时候，运行R脚本出现如下错误，请问怎么解决？这个aplot安装包安装也一直安装不了

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泛基因家族分析数据准备里面，运行命令保留最长转录本结果都会报错，说是找不到文件，但文件存在在data目录下， ./.gff3.gz does not exist，Please verify the input file name/path

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客服说泛基因组分析中26Pan-genes.list对应泛基因集分析章节中的final.last.gene.pair.txt文件，但是两者之间有差异，像是缺了几列是怎么回事，如下面详述，请解答

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泛基因组分析中26Pan-genes.list这个文件在自己要分析的物种中怎么生成？没有相关方法介绍

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执行cat ../id.txt|while read ind;do ln -s ../data/${ind}.fa.gz ./ ln -s ../data/${ind}.gff3.gz ./命令时，打开01.data_prepare文件里面的内容显示如下图所示

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存在缺失分析

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