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4110 个回答

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请问在进行MCScanX绘图那步是输出显示这样,没有图片出来是怎么...

看看你的collinearity文件有没有结果,没有结果当然跑不出来图来; 检查blast文件,gff文件有没有异常, blast文件生成比较慢,确保blast正确无误跑完;

回答于 2023-12-11 15:39

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做群体遗传分析,需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件?

群体分析用SNP就行了,indel用的少

回答于 2023-12-11 10:21

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请问在运行MCSCANX查找共线性时出现这个html文件是这样的,是怎...

gff和blast文件的前缀要保持一致,你看看的课程例子的:

回答于 2023-12-11 10:20

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老师您好,我想做KaKs批量计算,但是我之前下载的版本是旧版本,...

这个在新课程里面已经更新了,你可以直接观看:https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp 如果过期,你可以看这个文章自己设置分析:https://www.omicsclass.com/article/1939

回答于 2023-12-11 10:15

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请问命令怎么在服务器上跑

你有服务器,用putty连接服务器就可以输入命令在服务器上分析数据了; 我们组学大讲堂提供云服务器可以了解一下:https://study.omicsclass.com/index

回答于 2023-12-11 10:13

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请问我把命令放后台,然后电脑关机想第二天在做的话,命令可以在...

你的命令在服务器上跑就行,服务器不关机

回答于 2023-12-08 20:05

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blastp比对中,为什么相同的Query id与Subject id会有两条不同的...

blast为局部比对工具,两个比对上的位置不一样;

回答于 2023-12-08 20:04

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老师运行“ls aln_out/*.cds_aln.fasta |while read a;do sed -r...

你需要用seqkit合并数据之后才可以得到这个结果; 查看一下,是否有空的比对结果;

回答于 2023-12-08 16:19

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老师运行“ls aln_out/*.cds_aln.fasta |while read a;do sed -r...

物种命名格式和例子一样吗?检查对比课程例子, 看看alignout文件夹里面的cds比对文件是否正常;

回答于 2023-12-08 09:57

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群体研究合辑work.sh脚本运行问题2

自己的服务器需要自己配置安装软件,你自行安装配置,或者付费帮忙配置 picard

回答于 2023-12-08 09:54