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测序数据合并后只有一个fastq文件如何export为全局变量
一个文件用文件路径表示即可；linux基础不好建议学习：https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ
回答于 2024-02-26 09:38
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Path 'manifest.txt' does not exist.是合并后的数据，export sh...
设置完变量，可以用ll检查一下文件路径是否设置错误，如果错误及时更正； ll $workdir/manifest.ckd.txt
回答于 2024-02-26 09:36
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变异结果过滤
这个我不知道你的测序深度，还有物种基因组大小，还有你过滤的参数；不好评估SNP数量上的多少是否合理。 建议多尝试过滤参数，在质量和数量上取一个平衡；符合自己的预期即可；
回答于 2024-02-22 15:30
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老师，我前面问的那个nohup命令很快就结束，您让我用file查看gz...
看了你的问题，你看看视频里面输入的是gz压缩的文件吗？不是的话可以解压一下再输入，批量解压文件：gunzip *gz
回答于 2024-02-21 09:55
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用samtools call出单个样本的rawvcf文件，合并之后发现samtools...
samtools 结合 bcftools call SNP； 建议你用我嘛课程里面GATK流程吧，比较主流；
回答于 2024-02-20 14:41
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请问出现以下情况是什么错误呢
显示你的服务器账号的存储不够了，把多余的数据删除一些吧：disk exceed；容器没有启动成功； 共享服务器只做练习使用；分析自己的数据可以购买我们的服务器：https://study.omicsclass.com/index
回答于 2024-02-20 10:14