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我做circos图的时候发现因为两个基因距离太近因此没法显示全，只...
最好有截图说明自己的问题。 下面的配置文件可以绘制如下图片，你可以试一下： 更多见：《基因家族分析实操课程》： chromosomes_units=1000000 #刻度单位Mb#chromosomes_reverse=/[12345]/ #染色体反转karyotype=./chr.info #染色体信息配置文件show_tick_labels=yesshow_ticks=yesspacing=10u<ticks> ...
回答于 2018-12-19 08:50
绘制转录本图，无法提取文件
你的输入文件我看不到，无法分析原因，因为每个人输入的文件不一样，我无法分析原因。 你应该把自己所有的输入文件都截图展示一下，我才好分析原因； 最好把代码也粘贴一下；
回答于 2018-12-19 08:47
老师，麻烦您帮我看一下我在做共线性分析时用到vlookup, 方法跟...
看你的公式应该是没有写错： 1.手动搜索确认一下，在sheet2中复制一个ID在sheet1中搜索一下，确定是否在sheet1中存在sheet2中的ID； 2.如果确认确实存在ID，是不是公式没有拉到excel底部？
回答于 2018-12-18 10:18
麻烦求助，在使用ncbi_gff_2_Ensembl_gff.pl这个脚本的时出现报...
尽量不要使用NCBI上的基因组，处理起来比较麻烦。可到ensembl，JGI等网站下载。 或者到物种专门的基因组网站下载。
回答于 2018-12-17 22:41
老师，我想问一下，我在预测顺式作用元件时，在提取出来的基因上...
正常的，基因组中基因上游可能没有组装成功；所以截取到了带有N的序列； 你可以检查一下基因组是否是这样；
回答于 2018-12-17 15:27
用ncbi搜索pfam号 为什么没有 出来的是pmid 怎么办 文章也没有pf...
如何查找Pfam号：https://www.omicsclass.com/question/268 如果还是查找没有，说明你研究的基因家族本身就没有pfam号；
回答于 2018-12-17 15:25
对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢？
火山图是做完差异分析之后才能绘制；与标准化数据无关； 绘制火山图见：https://www.omicsclass.com/article/191
回答于 2018-12-17 10:39
老师，我在做共线性分析时，在准备配置文件时有一些关于染色体的...
pt 和mt 一般是叶绿体和线粒体，通常不做共线性分析； 如果要做的话，染色体名字是什么就填什么，不一定非要都是数字，0也可以；
回答于 2018-12-17 10:35
MCScanX family_circle_plotter 运行错误
截图内容太少，无法分析原因； 只能给你建议： 检查输入文件路径是否写错，命令行是否写错，输入文件格式数据编写错误；
回答于 2018-12-17 10:33