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擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

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4089 个回答

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get_gene_weizhi.pl 脚本修改

还有输入文件呢》不然我这里也帮不了你; 尽量不要用NCBI上的参考基因组,整理的不好;

回答于 2018-12-29 16:54

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用什么软件可以直接画出染色体Ks值的箱线图?数据格式如下

R语言里面的ggplot可以,具体可以看《ggplot绘图课程》

回答于 2018-12-29 15:41

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Perl脚本的解释

视频里面没讲,是因为对于新手来说,这行代码意义不大;要是细细去讲解对于新手来说又比较深奥,不一定能完全理解; 如果想真正理解,具体可以参考:https://www.omicsclass.com/article/659 理解不了也没有关系,把这一行删除就行; 不影响perl脚本的运行;

回答于 2018-12-29 13:15

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请问在把基因预测中,靶基因与转录因子关系中:tf_cor_target"NA...

问题不清楚,用什么预测的?  NA就是没有靶基因吧

回答于 2018-12-29 11:59

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 最后生成的图有9个染...

检查你这9条染色体上基因的位置信息bed文件和cds文件是不是太少,缺了?

回答于 2018-12-28 21:58

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TBtools 的others界面下没有BioSequence Structure Drawers——Ama...

看好TBtools的版本,你的版本太老,你更新一下:https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases 这篇文章中的版本红色方框:https://www.omicsclass.com/article/382

回答于 2018-12-28 21:29

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Perl相关软件的安装

java版本不对,看看这个常见错误:https://www.omicsclass.com/article/229

回答于 2018-12-28 16:01

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基因家族成员如何取舍,命名?如何查找外显子和内含子结构?

1.无参转录组组装的结果,无法知道内含子外显子,所有这个结构没法分析,要是有参的可以到基因组注释文件gff文件得到基因结构信息; 2.关于基因的命令自己重新编号就行:可参考基因家族文献解读命名方法 3.不完整的基因可以舍弃,也可以不舍弃,写文章的时候说明一下就好了,不用纠结; 但是做分析建议用完整结构域的基因...

回答于 2018-12-28 14:24

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构建进化树出现问题

序列差异太大,删除些gap:https://www.omicsclass.com/article/221

回答于 2018-12-28 13:40

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老师好,我在做课时20 比较基因组学分析时 在/biosoft/miniconda...

看文件格式输入没有问题,检查Pt.bed文件ID找不到: 1.检查bed文件除了tab空白是不是还有空格 2.检查文件名字是否正确,Pt.bed  Pt.cds

回答于 2018-12-28 09:00