检查你的links文件,里面是不是有一行位置重复链接到了自己,或者有一行两个基因挨的很近,所以链接又回来了; 然后就出现上面的情况; 基因名字重叠,只显示一个:可以参考这篇文章:https://www.omicsclass.com/article/644 添加设置这个参数:
回答于 2019-01-18 16:13
基因家族成员命名,自己决定就行,一般按照基因在染色体出现的顺序取名就行,不一定非要按照他那种方法取名,自己决定就行; 至于同源取名我这边不太清楚,你再看看文献;
回答于 2019-01-17 19:28
这个网站可以分析氨基酸序列的信息,你想要的都有:http://web.expasy.org/protparam/ 注意输入的序列,不要有ID行,纯序列就行: 结果如下: 更多基因家族分析见: 《基因家族分析视频课程》《基因家族分析文献详解》
回答于 2019-01-17 11:10
文献上已鉴定出来的此类家族一般成员同时含A,B,C;或者含A,B;或者B,C就说明是属于这个基因家族. 你忽略D结构域就可以;有 AB就算;
回答于 2019-01-16 14:13
很明细你输入的基因ID列表和gff中的基因ID列表不一致,所以没有提取成功: 注意红框框处;
回答于 2019-01-15 11:11
审稿人要是知道确切数量,那他自己肯定鉴定过,发过这个物种这个家族的文章,你的文章肯定发不了; 一个家族的成员的数量,有多有少,在不同的物种中差异不会太大;审稿人也会根据其他物种中这个家族大概有多少个,相差别太大就行。 更多可观看:《基因家族分析实操课程》
回答于 2019-01-15 11:06