omicsgene 的回答 - 组学大讲堂问答社区

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磷酸转运蛋白家族（PHT1）在Pfam上关键字搜不到pfam 号，在文章...

如何查找基因家族pfam号，参考：https://www.omicsclass.com/question/268 如果发表的文章都没有提到用pfam号，那你的这个家族基因很有可能就没有pfam号；

回答于 2019-03-14 14:23

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关于基因家族基因串联重复基因和片段复制概念可以参考：https://www.omicsclass.com/question/1 你贴图中如果是用mcscanX分析出的几个，我推测蓝色的连线都是segmental duplication events

回答于 2019-03-14 14:19

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是的，转录组表达定量，说的就是高通量测序数据。如果经费有限，可以使用以前实验室发表过的文章数据，或者使用别人发表的数据也是可以的，这样成本就降低了；

回答于 2019-03-14 14:17

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如果审稿人不提意见的话就可以发。

回答于 2019-03-14 09:01

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请将运行的脚本，还有所有的输入文件都截图，图文并茂的详细描述问题。不然我这里根据你现有提供的信息无法找到原因；这个问题和你的挺相似的或许可以帮助你：https://www.omicsclass.com/question/994

回答于 2019-03-12 17:14

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可以做转录组做基因表达绘制热图，也可以筛选一些家族基因做荧光定量PCR呢，最好两种都做。具体可以学习：基因家族文献思路解读实操课程可学习：基因家族分析实操课程、

回答于 2019-03-12 17:11

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提取序列，不知道你用的是哪个脚本？怎么运行的，输入的文件是什么？这些都可以截图说明，方便我这里分析原因；我推测原因： 1.fasta文件，> 后面第一个空格前面的才是序列ID，其他都是序列注释信息，脚本不会读取注释信息； 2.输入的ID列表，要和fasta文件的ID对应一致，才能正确提取成功。

回答于 2019-03-12 17:08

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可以参考KEGG代谢通路详解说明：https://www.omicsclass.com/article/12

回答于 2019-03-11 16:33

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蛋白质三维结构展示预测，可以用这个在线软件完成：I-TASSER server 这个我用的不多，你自己看看网站使用说明吧；参考文献： https://academic.oup.com/nar/article/43/W1/W174/2467872

回答于 2019-03-11 16:18

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可以的。转录组重原始测序数据到表达量，建议学习：二代测序转录组数据自主分析如果已经有表达量数据检验学习：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 linux系统的使用学习：linux系统使用、biolinux搭建生物信息分析环境

回答于 2019-03-11 13:16