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4106 个回答

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我从unigene序列预测到ORF,对应的cds序列直接用于引物设计就可...

可以进行引物设计。无参组装的基因,尽量挑选一些可靠的基因进行引物设计验证; 比如,表达量相对高一些的基因。

回答于 2019-02-13 09:58

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转录组数据分析中的NR_Description中的PREDICTED: BAHD acyltran...

PREDICTED 就是预测的,没有经过实验验证的;

回答于 2019-02-13 09:56

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在转录组数据中为什么有一些没有NT,NR注释,但是有blast注释。想...

转录组中的NT和NR注释都是同源基因注释,即用自己基因的序列去NR或者NT数据库中的基因序列进行blast同源比对,如果比对上数据库中的某个基因,即两个基因相似性很高,这样我们认为我们的基因也具有数据库中这个基因的功能,就得到了注释信息; 你想找没有功能注释的基因,找到了,又有什么意义呢?你也不知道他的功能,...

回答于 2019-02-13 09:55

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如何进行go的注释和富集

如果是人或者模式动植物,可以到ensembl网站的biomart工具下载得到:https://www.omicsclass.com/video/16  如果是非模式动植物,需要使用blast2go,blast工具手动分析,查找GI号才行;

回答于 2019-02-13 09:41

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老师,您好,请问知道登录号的情况下,怎么在EMBL数据库里下载全...

EMBL数据库用的不多,没有在里面提取过基因表达数据。

回答于 2019-02-13 09:35

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学习中遇见的问题

错误已经提示,注意空格: linux基础不好建议学习: 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、perl入门到精通、perl语言高级、R语言入门、R语言画图

回答于 2019-02-13 09:33

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关于python版本的MCScanX绘图问题

看你做的结果图是对的了。添加了颜色的行才显示红线。你的图片上已经显示出来了;

回答于 2019-02-10 20:19

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在学习基因鉴定家族课程中,我尝试做草莓基因Mapk基因家族的鉴定...

ensembl没有草莓的基因组,你可以在其他网站搜索查找;或者查阅草莓基因组的文献。

回答于 2019-02-10 20:18

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Hisat2-building建立index中的killed问题

内存不够,histat 建立索引内存需求很大,你参考基因组3.4G,需要几百G以上的内存。

回答于 2019-02-10 20:16

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共线性分析

MCScanX分析共线性,是利用基因组上所有基因做共线性,之后再做家族基因之间的共线性;

回答于 2019-02-01 11:43