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请问老师我下载了根,茎,叶,花,种子的转录组数据,怎么做成基...

如果只有原始数据fastq文件或者NCBI上下载的sra数据,就需要自己手动比对,定量分析。如果没有实验室没有服务器,自己得笔记本分析原始测序数据很吃力,不建议分析。 有兴趣可以看这门课程:二代测序转录组数据自主分析 我们公司也也可以分析转录组数据,可以联系我们,18510686772

回答于 2020-02-17 10:03

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您好,我想问下使用CMplot包绘制曼哈度图,怎么能让某个感兴趣的...

cmplot 好像没有这个功能。 建议单独绘制这条染色体,然后用AI合成两张图:

回答于 2020-02-17 09:57

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你好!我在Rstudio中做cox分析时由于数据量巨大,有37万之多,目...

电脑性能差,还有基因数量多运行时间就会长。 你也可以先取少量基因测试一下

回答于 2020-02-17 09:51

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请问老师基因家族单纯的只做视频那一套+荧光定量,能发sci吗?不...

可以发的,我们组学大讲堂网站上有很多例子文章。 投稿试一下,补实验或者数据再分析也来得及。 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读

回答于 2020-02-17 09:50

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在运用Linux系统命令,KA/KS,计算重复串联基因时,出现的duplic...

blast比对的特点,有时候部分比对也会有结果。  根据需要可以选择需要的数据。

回答于 2020-02-16 09:12

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请问老师,我做油菜的一个基因家族,共线性分析没有加倍的基因,...

首先检查一下分析的过程是否有错误,如果没错可能你研究的家族本身没有基因通过共线性发生加倍现象。 不同的家族特点不一样,分析没有人为错误不影响发文章。

回答于 2020-02-16 09:10

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基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤?

这个根据自己分析数据的需要进行过滤,如果不过滤有些区域太短有可能不可靠。  自己分析可以适当调低这个参数。

回答于 2020-02-16 09:08

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生信分析为什么要学习linux系统,好多不是直接通过windows系统的...

你可以分析一下高通量测序数据试试(二代,三代数据等等),从原始的fastq文件分析。windows只能分析少量的数据; 打了的几十G甚至上T的数据你再试试windows,估计打开都困难别说分析了; 再看看生物数据分析高手为什么选择用Linux:https://www.omicsclass.com/article/56 如果你只是一些表格类的少量数据要处理,愿...

回答于 2020-02-15 16:13

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circos 这个图

看看这个 chr.info文件里面的染色体标号和其他文件是否一致: https://www.omicsclass.com/question/1399

回答于 2020-02-15 16:09

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运行二次搜索结构域命令的问题

命令行最左边,perl  别丢了;

回答于 2020-02-14 17:49